Elmanın uzun süre tazeliğini, dokusunu ve besin değerini koruyabilmesi için en etkili yöntemlerden biri soğukta muhafazadır. Ancak günümüzde yalnızca soğutma yeterli görülmemekte; modern üretim ve depolama tesislerinde, atmosfer koşulları da hassas biçimde kontrol edilmektedir.

Bu sistemlerde, depolama odalarının iç atmosferi özel ekipmanlarla düzenlenir. Oksijen seviyesi minimum düzeye düşürülürken, karbondioksit oranı belirli ölçüde artırılır. Bu sayede elmanın solunumu yavaşlatılarak olgunlaşma süreci kontrol altına alınır.

Ayrıca, elmanın doğal yaşlanma sürecinde önemli rol oynayan etilen gazı da sistemden uzaklaştırılır. Depo içerisindeki etilen absorberi (etilen tutucu) bu gazı ortamdan temizlerken, elmanın etilen üretimini baskılayan 1-MCP (1-metilsiklopropen) uygulamaları da olgunlaşmanın geciktirilmesinde yüksek etki sağlar.

Tüm bu işlemlere ek olarak, depolarda bulunan nemlendirme sistemleri, ortam nemini sabit tutarak meyvenin su kaybını önler. Böylece, elmalar 0 °C civarındaki sıcaklıklarda uzun süre boyunca doğal görünümünü ve tazeliğini koruyabilir.

Bu gelişmiş kontrollü atmosfer depolama sistemleri sayesinde, uygun çeşitlerdeki elmalar bir yıla kadar firesiz şekilde muhafaza edilebilir. Aynı zamanda bu yöntem, ürünlerin raf ömrünü önemli ölçüde uzatarak pazarlama sürecinde yüksek kalite standartlarının korunmasını sağlar.